بر اين حقيقت واقفيم که بيوگاز به عنوان صورت پاک و تجديد پذير انرژي (به ويژه در بخش روستايي )، به خوبي مي تواند جايگزين منابع متعارف انرژي مانند سوختهاي فسيلي شود. اما در عين وجود مزاياي متعدد، پتانسيل فنآوري بيوگاز با محدوديتهاي خاصي نيز همراه بوده است. در اين ميان شايعترين محدوديتهاي ممکن عبارتند از: زمان ماند هيدروليکي طولاني 50-30 روز ، کاهش توليد گاز در زمستان، نوسانات شديد دماي شبانه روزي هاضم و غيره. براي غلبه بر اين .